A propos de nous

L'Institut de Microbiologie du Centre Hospitalier Universitaire Vaudois (CHUV) à Lausanne dirigé depuis 2011 par le Professeur Gilbert GREUB est un centre de référence en Suisse dans le domaine de la microbiologie médicale. Fondé sur une expertise solide et une recherche innovante, l'institut joue un rôle essentiel dans le diagnostic des maladies infectieuses et dans la lutte contre les agents pathogènes résistants aux traitements.

Les missions principales de l'institut incluent le diagnostic microbiologique avancé, la surveillance épidémiologique, ainsi que la recherche fondamentale et clinique sur les mécanismes de résistance et l'évolution des agents pathogènes. En tant que partie intégrante du CHUV, l'institut contribue également à la formation continue des professionnels de santé et à l'éducation du public sur les questions liées à la microbiologie et à la santé publique.

Grâce à ses équipements de pointe et à son équipe multidisciplinaire de chercheurs, médecins et techniciens, l'Institut de Microbiologie du CHUV s'engage à améliorer constamment les pratiques diagnostiques et thérapeutiques, ainsi qu'à répondre aux défis croissants posés par les maladies infectieuses dans un contexte mondial en évolution.

Diagnostic

L'Institut fournit des diagnostics microbiens pour les patients hospitalisés et pour les patients externes. Il sert de centre de référence pour plusieurs bactéries intracellulaires et pour les papillomavirus humains, et il est actif dans le développement de nouveaux tests.

Notre panel d'experts biomédicaux est à votre disposition.

L'activité diagnostique, intégrée au Département des Laboratoires du CHUV, est reconnue par Swissmedic (autorisation 28411) et accréditée sous ISO / CEI 17025 (STS328). Elle est distribuée en 5 domaines fonctionnels.
Microscopie et cultures utilisant principalement des outils de diagnostic classiques ainsi que MALDI-TOF pour le diagnostic de bactéries, de champignons et de parasites
Diagnostic moléculaire pour le diagnostic de l'ensemble du spectre des agents microbiens, y compris les virus, avec des tests moléculaires basés sur la PCR, ainsi que des mycobactéries avec des tests non moléculaires
Sérologie pour le diagnostic de la réponse immunitaire humorale à un panel complet d'agents microbiens
Génomique/métagénomique pour le séquençage rapide de génomes bactériens complets et leur annotation pour la découverte de microbes en relation avec les soins aux patients
Tests rapides pour des situations critiques pour lesquelles des résultats très rapides ont une incidence directe sur les décisions d'hospitalisation, d'isolement, de traitement ou d'investigation.

Recherche

La recherche en bactériologie est axée sur les bactéries intracellulaires, principalement les chlamydiae, et leur relation avec les maladies humaines
La recherche en mycologie vise à déchiffrer le mécanisme de résistance aux antifongiques et de virulence chez les pathogènes fongiques, y compris Candida albicans, ainsi que la génomique de Pneumocystis jirovecii
La recherche en virologie aborde plusieurs aspects de la recherche fondamentale sur les arénavirus humains pathogènes et le virus de l'immunodéficience humaine, ainsi que sur la gestion clinique des patients transplantés
La recherche et développement vise à mettre en place des méthodes modernes et de pointe en diagnostic microbien
Des thèmes suppémentaire sont représentés par des recherches associées ou collaboratives dans les domaines des infections nosocomiales, de la virologie des hépatites C et E, ainsi que des vaccins contre les papillomavirus humains et l'immunothérapie des cancers urogénitaux

Enseignement

Des membres de l'Institut de microbiologie enseignent aux étudiants d'orientation médicale ou biologique, à l'Université de Lausanne (UNIL) et aux écoles professionnelles.

L'Institut de microbiologie enseigne au sein de l'École de biologie et les étudiants sont intégrés dans des groupes de recherche pour terminer leur thèse de maîtrise. Des postes de thèse de doctorat sont disponibles dans les groupes de recherche de l'Institut.
L'Institut de microbiologie enseigne dans le programme de l'école de médecine.
L'Institut de Microbiologie participe aux cours et aux activités du Programme de Doctorat Thématique Sciences Microbiennes de l'Ecole Doctorale des Sciences de la Vie de la Faculté de Biologie et de Médecine (FBM) de l'UNIL.
L'Institut de microbiologie offre régulièrement des formations de troisième cycle FAMH
En plus de l'enseignement au niveau académique, l'Institut participe à l'enseignement dans les écoles professionnelles, telles que l'Ecole Supérieure de la Santé de Lausanne.

Communication Grand public

L'institut de microbiologie a plusieurs projets dans le domaine de la communication grand public :

Communication dans divers médias
Développement d'un jeu éducatif sur les microbes
Développement d'un site web "grand public" en partenariat entre K. Perron et M. Caine (BiOutils), Genève et C. Kebbi et G. Greub (IMU)
Organisation de conférences grand public
Intéractions avec la section "lay communication" de la société suisse de microbiologie
Accueils d'enfants lors de la journée "osez les métiers" ou à d'autres occasions.

Le domaine des 3R

Le principe des 3R vise à Remplacer, Réduire et Réformer le recours aux animaux en recherche par des méthodes alternatives. L'Institut de microbiologie est très actif dans ce domaine sur différents projets et/ou prestations de service :

Animalerie de quarantaine
Projet Galleria (Amorim-Vaz et al. Mbio 2015 ; Frontiers microbiol 2015 ; Delarze, virulence 2015)
Dicytostelium et Acantamoeba (Tosetti et al Microb Pathog. 2014 ; Kebbi-Beghdadi & Greub. Environ Microbiol Rep. 2014 ; Jacquier et al J Vis Exp. 2013 ; Rusconi et al, in preparation)
Zebrafish : collaboration F D’Amati + P Cosson + L Vaughan (Fehr et al, Frontiers Microbiol 2016)
Prix de la fondation E. Naef 2010
Prix fond Carlo de la fondation Lombard-Odier 2016
Collaborations avec P Cosson (détection rapide de la virulence)
Demande de soutien au décanat

Teambuilding

L'Institut de microbiologie encourage des activités permettant d'accroître les interactions entre les laboratoires des différents chercheurs et les laboratoires diagnostiques. A cet effet, les étudiants en thèse et les post-doctorants organisent différentes activités telles qu'afterworks ou concours.

En 2018, a eu lieu le concours "Champirus". L'objectif était de cuisiner un gâteau représentant un sujet scientifique idéalement en lien avec la microbiologie puis de le déguster ensemble. Chaque gâteau a été évalué quant à son goût, son aspect ainsi que la créativité de l'auteur. Vous trouverez ci-dessous le résultat final ainsi que les oeuvres ayant participé à ce concours :

Concours Champirus et résultats

Parmi les 61 projets retenus pour les Starting Grants du Fonds national suisse 2024, cinq sont menés par des chercheur·euses de la Faculté de biologie…