L'Institut de microbiologie coordonne l'enseignement de la microbiologie (leçons ex cathedra et travaux pratiques) au sein du curriculum de l'école de médecine, pour la deuxième année (module 2.2) et la troisième année (module 3.3) du Bachelor de médecine. Les enseignants de l’institut de microbiologie participent non seulement à l'enseignement en 2ème et 3ème année mais également en 4ème et 5ème année de médecine, dans le cadre d’un module optionnel en 4ème année de médecine (Master 1ère année) et dans le cadre du cours d’infectiologie en 5ème année (master 2ème année). Les enseignants impliqués à l'école de médecine incluent principalement Gilbert Greub, Damien Jacot et Frédéric Lamoth pour la coordination des travaux pratiques.
Certains membres de l'Institut interviennent dans divers aspects de la microbiologie et des maladies infectieuses au sein d'autres modules d'enseignement.
Gilbert GREUB
B2.2 - Microbiologie : concepts de base
B2.5 - Microbiologie : microbiote digestif
B3.3 - Microbiologie : pathogènes les plus importants
M1.9 opt17 - Microbiologie et infectiologie
M2.3 - Zoonoses
Microbiologie - Passerelle
Frédéric LAMOTH
B2.2 - Champignons
B3.3 - Mycologie médicale
B3.3 - Entérobactéries
M1.9 opt17 - Prendre en charge un patient suspect d'infection
M2.3 - Infections fongiques
M2.3 - Gastro-entérites
M2.3 - Infections intra-abdominales
M2.3 - ARC
M2.3 - Répétitoire
Alix COSTE
M1.9 opt17 - Infection sexuellement transmissibles
M1.9 opt17 - Infection urinaire
M1.9 opt17 - Visite de laboratoires
M1.9 opt17 - Pneumonies nosocomiales
M1.9 opt17 - Infections abdominales
M2.3 - ARC "Cas cliniques: quizz tropical"
M1.TM - Axe de recherche fondamentale - Question de recherche
M1.TM - Axe de recherche fondamentale - Protocole de recherche
M1:TM - Axe de recherche fondamentale - Lecture critique d'article