La mission globale du Service projets et organisation stratégiques est d'être au service de la réalisation des stratégies et objectifs institutionnels. Ses activités se déploient selon cinq axes principaux:

1) La conduite et le soutien de mandats, projets et programmes institutionnels

2) Le suivi et le reporting des projets stratégiques et qualité de l'Institution

3) Le développement cohérent de l'organisation et des structures institutionnelles

4) Le soutien aux démarches qualité institutionnelles

5) L'accomplissement de missions spécifiques, notamment en matière de gestion documentaire et archivage, de développement durable et de collaboration humanitaire.